Rozhodující je zejména právní forma školy, vlastnictví majetku, zřizovací listina a pravidla nastavená zřizovatelem.

Běžnou údržbu a menší provozní potřeby může škola zpravidla řešit samostatně v rámci svého rozpočtu a svěřených kompetencí. U větších oprav, technického zhodnocení, investic nebo významnějších změn majetku je nutné ověřit, zda je vyžadován předchozí souhlas nebo rozhodnutí zřizovatele.

Zřizovací listina musí vymezit majetek zřizovatele předaný příspěvkové organizaci k hospodaření a práva a povinnosti organizace k tomuto majetku.

V praxi je vhodné jednoznačně nastavit také pravidla pro údržbu, opravy, investice, pronájem, pojištění, nakládání s nepotřebným majetkem a případy, kdy škola potřebuje předchozí souhlas zřizovatele.

Nejprve je nutné ověřit, kdo je vlastníkem daného majetku a jaká oprávnění má škola podle zřizovací listiny.

Pravidla by měla určit, kdo může nájem schválit a uzavřít smlouvu, jak bude stanoveno nájemné a úhrada provozních nákladů a zda pronájem neomezuje hlavní činnost školy. Pokud o nakládání s obecní nemovitostí rozhoduje obec, je nutné posoudit také pravidla zákona o obcích, včetně případné povinnosti zveřejnit záměr.

Výpůjčka může být vhodná hlavně jako přechodné nebo doplňkové řešení. Pokud má škola budovu, pozemek nebo jiné klíčové prostory užívat dlouhodobě, měl by zřizovatel zvážit stabilnější nastavení majetkového zajištění. Ve smlouvě o výpůjčce musí být jasně uvedeno, jaký majetek se půjčuje, k jakému účelu, kdo zajišťuje údržbu, kdo hradí opravy, kdo řeší pojištění, jak se naloží s případným technickým zhodnocením a za jakých podmínek lze výpůjčku ukončit. U obecního nemovitého majetku je potřeba pohlídat také schvalovací postupy obce. 

Je nutné zjistit příčinu rozdílu a řádně jej zachytit a vypořádat podle účetních a inventarizačních pravidel.

Zřizovatel by měl při kontrole ověřit, zda škola rozdíly vysvětlila, napravila evidenci a případně přijala opatření, která zabrání opakování problému. Současně je vhodné porovnat evidenci se zřizovací listinou a skutečným způsobem užívání majetku.

Škola může nabývat majetek jen v případech stanovených zákonem, zřizovací listinou nebo rozhodnutím zřizovatele. Zřizovatel by měl mít jasně nastaveno, kdy škola může majetek nabýt samostatně a kdy potřebuje jeho předchozí souhlas, například u darů, většího vybavení nebo majetku s budoucími provozními náklady. 

Právní předpis nestanoví obecnou povinnost zřizovatele poskytovat samostatný příspěvek na odpisy v určité výši.

Způsob financování odpisů, tvorby fondu investic a obnovy majetku závisí na konkrétním nastavení hospodaření příspěvkové organizace a rozhodnutích zřizovatele. Důležité je, aby systém dlouhodobě umožňoval plánovat obnovu a investiční potřeby školy.